設施大棚的不可移動性導致了連作障礙的逐年加重，其中較為突出的問題就是土傳病蟲害問題，而近幾年農民反映為害尤為突出的是根結線蟲病，嚴重威脅到設施大棚的可持續發展。現階段，農民多選用化學藥劑對根結線蟲進行控制，包括廣譜的阿維菌素，或是噻唑膦，也有用棉隆和石灰氮等滅生性處理的藥劑。長期使用單一的化學藥劑很容出現抗性問題，滅生性的藥劑連同土壤中有益菌全部殺光，容易造成土壤板結，微生物菌群失衡等問題。農藥殘留也是化學藥劑使用后較為突出的問題，因此我們推薦農民使用生物菌來進行防治線蟲，可以有效避免上述問題的出現。生物菌劑能夠有效控制設施大棚根結線蟲的為害，保證設施大棚作物產量及食品安全。如何使生物菌劑發揮最大的功效，正確的使用方法是前提。

目前大部分大棚的移栽苗都是采用無土育苗，這樣很好的防止了幼苗的帶蟲，但仍有部分大棚采用本土育苗，如果消毒不到位，很容易導致幼苗就帶蟲，后期很難進行防治。因此田間最好采用無土育苗的移栽苗，如果本土育苗也要保證育苗土壤的充分消毒殺蟲。

根結線蟲病是土傳病害，在保證幼苗不帶蟲的前提下，還要保證土壤中沒有或只有為害基線以下的蟲卵數。在根結線蟲病發生嚴重的大棚，我們建議在使用生物菌的第一年夏季高溫時進行燜棚處理時加入石灰氮或棉隆，以此來壓低蟲口基數。如石灰氮使用量為每畝25～50公斤（可根據棚內情況適量添加腐熟有機肥和餅肥），土壤翻耕，適當進行澆水或灌水，保持土壤含水量70%以上，促使線蟲和病菌游離出來，用農膜密閉大棚防止漏氣，利用石灰氮分解中間產物和伏天高溫及有機肥分解產生的能量進行土壤消毒；農膜覆蓋時間不低于20天，持續高溫時間不能低于15天，覆蓋時間越長效果越佳；為保證土壤高溫，最好再加一層地膜，進行雙層燜棚；揭膜后田間水讓土壤自然吸干，然后畝撒施鈣鎂磷肥25公斤，用開溝機開溝作畦，間隔10天后再種植作物。

做好土壤消毒后，保證田間線蟲基數較低的情況下，移栽時對幼苗的保護必不可少。使用江蘇省農科院植保所研制的新型生防菌解淀粉芽孢桿菌B1619能夠有效防治根結線蟲病。并且該菌具有強烈的抑菌、殺線作用，能夠在移栽苗的根圍形成保護隔離層，還可誘導植株產生抗病性，并促進作物的生長。具體使用方法如下：1）植物幼苗定植處理土壤——定植前，將生防菌粉B1619按6克/棵的比例均勻地撒入在定植溝穴中，充分與土壤混勻，隨后移植幼苗，澆透活棵水。2）植物幼苗根部施用菌粉 ——定植后，在第2次澆灌水之前，將生防菌粉按3克/棵的比例撒在幼苗根部，隨后澆水，或按3克/棵的用量兌水，充分攪拌后澆灌。使用該顆粒劑后，及時觀察幼苗生長情況，確保水分充足。

用過生物菌劑的田塊，建議第一年高溫燜棚加入藥劑處理后，以后每年夏季仍采用高溫燜棚，但可不加滅生性化學藥劑。每次移栽時都要加入生物菌劑，以確保土壤中有益菌群的平衡，將根結線蟲控制在經濟為害值以下。生防菌在土壤中有富集效應，在出現良好效果后，仍需按上述所說進行操作，保證有益菌群的穩定，確保作物的恒產、高產。